真菌界之基础真菌中微孢子虫门:
微孢子虫门（icrosporidia）是一类专性细胞内寄生的单细胞真核生物，传统上被归类为真菌，但其分类地位曾存在争议（近年研究多支持其属于真菌界）。以下是微孢子虫门下的全部纲级分类：
微孢子虫门（icrosporidia）的纲级分类
1 裸孢子纲（arhizophidea）
特征：孢子缺乏极丝（por fint）或极丝退化，寄生在无脊椎动物。
示例：nucleophaga（核噬虫属）。
2 双单孢子纲（dipodophylidea）
特征：孢子具双核，极丝结构简单。
示例：dipodophyea。
3 微孢子纲（icrosporea）
最大且多样性最丰富的纲，包含大多数已知的微孢子虫。
特征：孢子具典型极丝，可感染脊椎动物（包括人类）和无脊椎动物。
重要目：
ggeida目（如 ggea、encephalitozoon）
icrosporida目（如 nosea，蜜蜂病原体）。
4 变形孢子纲（tchnikovellea）
特征：孢子形态特殊，主要寄生在节肢动物（如甲壳类）。
示例：tchnikovel。
5 奇孢子纲（arosporidea）
特征：海洋环境中发现的类群，宿主多为海洋无脊椎动物。
示例：arospora。
注意事项
分类变动：微孢子虫的分类系统仍在更新中，部分纲可能因分子系统学研究被调整或合并（如 icrosporea 下的部分类群可能重新划分）。
医学相关属：人类病原体多属 icrosporea 纲（如 encephalitozoon、enterocytozoon）。
真菌界（fungi）中的 隐真菌门（cryptoyta） 是一类较新发现的、基础的真菌类群，它们与传统的壶菌门（chytridioyta）和微孢子虫门（icrosporidia）有一定的亲缘关系。隐真菌门的成员多为寄生或腐生单细胞生物，缺乏典型的真菌细胞壁（几丁质），但具有真菌的分子特征（如18s rrna基因序列）。
隐真菌门（cryptoyta）的纲级分类：
1 罗兹菌纲（rozelloyta / rozellida）
代表类群：rozel（罗兹菌属，寄生其他真菌或藻类）。
特征：无细胞壁（或仅有极薄的细胞壁），具有游动孢子阶段。
2 微孢子虫相关类群（icrosporidiareted cdes）
部分隐真菌可能与微孢子虫（icrosporidia）有共同祖先，但尚未完全归类。
3 其他未定纲类群
如 cry1、cry2 等环境序列分支（可能代表新的纲）。
重要说明
隐真菌门 vs 罗兹菌门（rozelloyta）：部分研究将隐真菌门拆分为 罗兹菌门（rozelloyta） 和 隐真菌门（cryptoyta ss），但目前仍存在争议。
分类变动：由于隐真菌的基因组研究仍在进行中，未来可能会有调整（如新增纲或合并）。
真菌界之壶菌及相关类群中壶菌门：
真菌界的 壶菌门（chytridioyta） 是一类原始的、具有 鞭毛游动孢子 的真菌，主要生活在淡水、土壤或寄生在动植物上。壶菌门下的纲级分类如下：
壶菌门（chytridioyta）的全部纲
1 壶菌纲（chytridioycetes）
最常见、多样性最丰富的纲，包括大多数自由生活或寄生的壶菌。
特征：具有后鞭毛（单鞭毛）游动孢子，菌体为单细胞或简单菌丝体。
代表属：
chytridiu（壶菌属）
batrachochytriu（蛙壶菌属，如 b dendrobatidis，导致两栖类壶菌病）
synchytriu（集壶菌属，植物病原菌）。
2 单毛壶菌纲（onoblepharidoycetes）
特征：游动孢子具单根前鞭毛，菌体可形成 假菌丝 或 简单菌丝体。
代表属：
onoblepharis（单毛壶菌属）
gonapodya（腐生水生真菌）。
3 新壶菌纲（neocalliastigoycetes）
特征：厌氧性，无游动孢子阶段，生活在反刍动物（如牛、羊）的瘤胃中，帮助分解纤维素。
代表属：
neocalliastix（新壶菌属）
orpoyces（瘤胃厌氧真菌）。
4 间壶菌纲（sochytrioycetes）
较新的分类，基于分子系统学（2018年后部分研究支持）。
特征：介于壶菌纲和单毛壶菌纲之间，部分种类寄生藻类。
代表属：
sochytriu
5 其他未完全确定的类群
部分环境dna序列可能代表新的纲，但尚未正式命名（如 cde x）。
重要说明
分类变动：壶菌门的系统发育研究仍在更新，部分纲可能被调整（如 sochytrioycetes 是否独立仍有争议）。
蛙壶菌（b dendrobatidis） 是重要的病原体，属于 壶菌纲，影响全球两栖动物。
新壶菌纲（neocalliastigoycetes） 是唯一的 厌氧真菌，在生态和生物能源研究中很重要。
真菌界的 新美鞭菌门（neocalliastigoyta） 是一类专性厌氧的真菌，主要栖息于反刍动物（如牛、羊）的消化道中，帮助分解植物纤维素。该门最初被归类为壶菌门（chytridioyta）的一部分，但因其独特的 无游动孢子、多鞭毛、严格厌氧 等特征，现已被提升为独立的门级分类单元（根据 hibbett et al, 2007 及后续研究）。
新美鞭菌门（neocalliastigoyta）的全部纲
目前，该门仅包含 1个纲，但可进一步划分为不同的目和科：
1 新美鞭菌纲（neocalliastigoycetes）
特征：
严格厌氧，依赖宿主（反刍动物或某些昆虫）的厌氧环境生存。
无典型游动孢子阶段，但具有 多鞭毛的游动细胞（如 neocalliastix 的游动孢子具420根鞭毛）。
菌体形态多样，包括 多核菌丝体 或 单细胞 形式。
主要目及代表属：
1 新美鞭菌目（neocalliastigales）
代表属：neocalliastix（新美鞭菌属）、orpoyces（瘤胃真菌）
典型特征：多鞭毛游动细胞，广泛存在于牛、羊瘤胃中。
2 厌氧壶菌目（anaeroycetales）
代表属：anaeroyces（厌氧壶菌属）、caeyces（盲囊菌属）
特征：菌体形态简单，适应极端厌氧环境。
3 多鞭毛菌目（piroyces）
代表属：piroyces（多鞭毛菌属）
特征：游动细胞具多根鞭毛，常见于马、象的肠道。
分类学争议与更新
该门分类相对稳定，但部分属（如 cylyces）的系统位置仍在研究中。
由于依赖分子数据（如 18s rrna、its），未来可能细化或新增分类单元。
如需最新信息，建议查阅：
ncbi taxonoy（搜索 neocalliastigoyta）
《fungal diversity》 或 《ylogia》 期刊的相关研究。
真菌界之接合菌类中接合菌门:
现代分类体系下的接合菌相关类群（原接合菌门的纲）
根据最新的真菌分类系统（如 《fungal systeatics and evotion》），原接合菌门的成员被划分为以下几个 门或纲：
1 接合菌门（zygoyta ss，狭义接合菌门）
（部分研究仍保留此名称，但多数已拆分）
毛霉纲（uroycetes）
特征：菌丝无隔，无性繁殖产生孢囊孢子，有性生殖形成接合孢子（zygospore）。
主要目：
毛霉目（urales，如 ur, rhizop）
被孢霉目（ortierelles，如 ortierel）
内囊霉目（endogonales，如 endogone）
2 梳霉门（zoopagoyta）
（原接合菌门中的捕食性或寄生性类群）
梳霉纲（zoopagoycetes）
特征：寄生或捕食小型生物（如线虫、原生动物）。
代表属：zoopage, stylopage
虫霉纲（entoophthoroycetes）
特征：寄生昆虫（如 entoophthora 感染苍蝇）。
3 球囊菌门（gloroyta）
（与植物形成丛枝菌根共生关系）
球囊菌纲（gloroycetes）
特征：无性繁殖产生大型孢子（如 glo）。
4 其他独立分支
捕虫霉纲（basidioboloycetes）
特征：曾归类于接合菌门，现独立（如 basidiobos）。
蛙粪霉纲（kickxelloycetes）
特征：菌丝有隔，如 kickxel。
传统接合菌门的纲（已拆分）
（供历史参考，现多已废弃）
1 毛霉纲（uroycetes）
2 梳霉纲（zoopagoycetes）
3 虫霉纲（entoophthoroycetes）
4 内囊霉纲（endogonales）
5 捕虫霉纲（basidioboloycetes）
重要说明
分类变动：由于分子系统学的进展，接合菌门不再作为正式分类单元，而是被拆分为多个单系群。
临床相关类群：毛霉目（如 rhizop）可引起人类毛霉菌病（urysis）。
生态功能：球囊菌门（gloroyta）对植物营养吸收至关重要。
如需最新分类，建议查阅：
ncbi taxonoy
《fungal diversity》期刊
spatafora et al (2016) 的《真菌高阶分类修订》
真菌界的 球囊菌门（gloroyta） 是一类专性 共生真菌，与大多数陆地植物形成 丛枝菌根（arbcur yrrhizae, a） 关系，对生态系统和农业至关重要。该门的分类相对稳定，目前仅包含 1个纲，但可进一步划分为多个目和科。
球囊菌门（gloroyta）的分类
1 球囊菌纲（gloroycetes）
特征：
专性共生：无法独立生存，必须与植物根系共生。
无性繁殖：产生大型厚垣孢子（如 glo）或丛枝孢子囊（如 acaulospora）。
无游动孢子，菌丝无隔（部分老年菌丝可能形成隔膜）。
主要目及代表属（根据 schu?ler & walker, 2010; redecker et al, 2013）：
1 球囊霉目（glorales）
代表属：glo（球囊霉属，常见共生菌）
特征：孢子直接生于菌丝上，无辅助细胞。
2 无梗囊霉目（diversisporales）
代表属：diversispora、gigaspora（巨孢囊霉属）
特征：孢子较大，部分种类有辅助细胞。
3 原囊霉目（archaeosporales）
代表属：archaeospora（古孢囊霉属）
特征：孢子形态原始，可能代表早期演化分支。
4 类球囊霉目（paraglorales）
代表属：paraglo（类球囊霉属）
特征：孢子微小，菌根结构较简单。
5 内养囊霉目（entrophosporales）
代表属：entrophospora（内养囊霉属）
特征：孢子生于菌丝内部，较少见。
分类学争议与更新
由于分子系统学（如 28s rrna、its 序列分析）的发展，部分属（如 glo）被拆分（如 rhizophag）。
目前 不承认其他纲，所有球囊菌均归于 gloroycetes。
生态与经济重要性
植物营养：帮助植物吸收磷、氮等营养。
农业应用：作为生物肥料（如 rhizophag irreguris）。
演化意义：可能与早期陆地植物共生（4亿年前）。
如需最新分类，建议查阅：
ncbi taxonoy（搜索 gloroyta）
《yrrhiza》期刊（菌根研究专刊）
真菌界之高等真菌中子囊菌门:
真菌界的 子囊菌门（asyta） 是最大的真菌门，包含约 64,000种（占已知真菌的60以上），涵盖酵母、霉菌、地衣及大型真菌（如羊肚菌、块菌）。子囊菌门分为 3个亚门 和 多个纲。以下是当前公认的分类框架：
子囊菌门（asyta）的主要分类
1 盘菌亚门（pezizoyta）
特征：形成多细胞的子实体（如盘菌、块菌），菌丝有隔膜。
主要纲：
1 盘菌纲（pezizoycetes）
代表：羊肚菌（orchel）、块菌（tuber）。
2 散囊菌纲（eurotioycetes）
代表：青霉菌（penicilliu）、曲霉菌（aspergils）。
3 座囊菌纲（dothideoycetes）
代表：植物病原菌（如 alternaria）、地衣共生菌（lichenostiga）。
4 粪壳菌纲（sordarioycetes）
代表：冬虫夏草（ophiordyceps）、赤霉菌（gibberel）。
5 茶渍菌纲（lecanoroycetes）
代表：地衣（如 cdonia、xanthoria）。
6 锤舌菌纲（leotioycetes）
代表：灰霉菌（botrytis）、核盘菌（sclerotia）。
7 虫囊菌纲（boulbenioycetes）
代表：昆虫寄生菌（如 boulbenia）。
2 酵母亚门（saharoyta）
特征：单细胞或假菌丝，无子实体。
主要纲：
1 酵母纲（saharoycetes）
代表：酿酒酵母（saharoyces cerevisiae）、白色念珠菌（candida albicans）。
3 外囊菌亚门（taphroyta）
特征：原始子囊菌，部分为植物病原菌。
主要纲：
1 外囊菌纲（taphroycetes）
代表：桃缩叶病菌（taphra deforans）。
2 肺孢子菌纲（pneuocystidoycetes）
代表：人类病原菌（pneuocystis jirovecii）。
3 裂殖酵母纲（schizosaharoycetes）
代表：裂殖酵母（schizosaharoyces pobe）。
争议与更新
新分类：部分纲（如 neolectoycetes）可能被合并或调整。
地衣化类群：许多地衣真菌属于盘菌亚门（如茶渍菌纲）。
医学重要性：酵母纲（如 candida）和粪壳菌纲（如 aspergils）含重要病原菌。
真菌界的 担子菌门（basidioyta） 是另一大类重要真菌，包含许多常见物种，如蘑菇、锈菌、黑粉菌、酵母等。担子菌门可分为 3个亚门 和 多个纲。以下是当前公认的分类框架：
1 伞菌亚门（agariyta）
特征：大多形成大型子实体（蘑菇、多孔菌等），包括食用菌和药用菌。
主要纲：
1 伞菌纲（agariycetes）
代表：蘑菇（agaric）、灵芝（ganodera）、木耳（auricuria）。
特点：子实体多样，包括伞菌、多孔菌、胶质菌等。
2 银耳纲（trelloycetes）
代表：银耳（trel）、隐球菌（crypto）。
特点：部分为酵母态，部分形成胶质子实体。
3 花耳纲（dacryycetes）
代表：花耳（dacryyces）。
特点：子实体通常呈胶质或蜡质。
2 锈菌亚门（puioyta）
特征：多为植物病原菌，包括锈菌和部分酵母。
主要纲：
1 锈菌纲（puioycetes）
代表：小麦锈菌（puia grais）。
特点：专性寄生，生活史复杂。
2 微球黑粉菌纲（icrobotryoycetes）
代表：icrobotryu（寄生于植物）。
3 混合酵母纲（ixioycetes）
代表：ixia osundae（蕨类植物寄生菌）。
3 黑粉菌亚门（tigoyta）
特征：主要为黑粉菌，引起植物黑粉病。
主要纲：
1 黑粉菌纲（tigoycetes）
代表：玉米黑粉菌（tigo aydis）。
2 外担菌纲（exobasidioycetes）
代表：exobasidiu（引起植物叶肿病）。
其他重要类群
walleioycetes（瓦氏霉菌纲）
代表：walleia（耐旱霉菌，常见于食品）。
entorrhizoycetes（根肿菌纲）
代表：entorrhiza（与植物根部共生）。
分类学更新与争议
分子系统学 导致部分纲的调整（如 assezioycetes 被归入锈菌亚门）。
酵母态真菌 在多个纲中存在（如银耳纲的 crypto）。
生态与经济重要性
食用菌：如香菇（lentu edodes）、松露（tuber）。
病原菌：锈菌和黑粉菌危害农作物。
工业应用：酵母（如 crypto）用于生物技术。
真菌界之争议或小门类中芽枝霉门:
真菌界的芽枝霉门（bstocdioyta）是一类较为原始的真菌，主要生活在淡水或潮湿土壤中，部分为动植物病原菌。，芽枝霉门包含1个纲，但可进一步划分为多个目和科。
芽枝霉门（bstocdioyta）的分类
1 芽枝霉纲（bstocdioycetes）
特征：
游动孢子：具有鞭毛，可在水中游动（类似壶菌）。
生活史：部分种类存在明显的世代交替（如二倍体与单倍体阶段）。
生态：多为腐生或寄生，部分感染昆虫、藻类或植物。
主要目及代表属：
1 芽枝霉目（bstocdiales）
代表属：
alloyces（异水霉属）：模式属，用于研究真菌有性生殖。
bstocdiel（小芽枝霉属）：寄生性较强。
elooyces（腔霉属）：专性寄生蚊虫幼虫（用于生物防治）。
特点：菌体呈假根状或分枝菌丝，部分种有性生殖明显。
2 雕蚀菌目（catenariaceae）（部分分类系统归入此目）
代表属：catenaria（链枝霉属），寄生线虫或小型无脊椎动物。
分类学争议与更新
与壶菌的关系：芽枝霉门曾归入壶菌门（chytridioyta），后因分子系统学研究独立成门。
生态多样性：部分种类（如elooyces）被研究用于控制蚊媒疾病（如疟疾）。
生态与经济意义
研究模型：alloyces 是研究真菌性别决定和减数分裂的重要材料。
生物防治：elooyces 可寄生蚊幼虫，潜在用于疾病防控。
真菌界的虫霉门（entoophthoroyta）是一类专性寄生或兼性腐生的真菌，主要感染昆虫、螨类及其他无脊椎动物，在自然界中具有重要的生物调控作用。根据最新的分类系统（如《outle of fungi and funglike taxa》(2020) 和 wijayawardene et al, 2022），虫霉门目前包含 2个纲，其分类基于形态、生活史及分子系统学研究。
虫霉门（entoophthoroyta）的主要分类
1 虫霉纲（entoophthoroycetes）
特征：
分生孢子：通过弹射机制主动传播（如“真菌大炮”现象）。
寄生性：专性寄生昆虫（如蚜虫、苍蝇）或螨类，部分种可人工培养。
菌丝结构：多核，无隔膜或仅部分分隔。
主要目及代表属：
1 虫霉目（entoophthorales）
代表属：
entoophthora（虫霉属）：感染蝇类（如家蝇）。
pandora（潘多拉霉属）：专性寄生蚜虫（如 pandora neoaphidis）。
nidiobos（分生孢霉属）：兼性腐生，部分种可感染哺乳动物（罕见）。
生态作用：在自然中控制害虫种群，部分用于生物防治。
2 新接霉纲（neozygitoycetes）
特征：
较晚发现：基于分子系统学独立分出。
寄生范围：主要感染螨类或小型节肢动物。
代表属：
neozygites（新接霉属）：如 neozygites floridana，寄生螨类（如红蜘蛛）。
分类学争议与更新
历史归属：虫霉门曾归类于接合菌门（zygoyta），后因分子证据独立成门。
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医学相关性：少数 nidiobos 和 basidiobos（现归入basidioboloyta）可感染人类（罕见皮下或鼻腔感染）。
生态与经济意义
生物防治：如 entoophthora cae 用于控制蝇类害虫。
基础研究：分生孢子弹射机制是生物力学研究模型。
真菌界的单毛菌门（onoblepharidoyta）是一类较为少见的水生真菌，属于早期分化出的真菌类群之一。其最显着的特征是产生具有单根后生鞭毛（whipsh型）的游动孢子（与壶菌相似，但鞭毛数量不同）。单毛菌门目前仅包含 1个纲，但可进一步划分为多个目和科。
单毛菌门（onoblepharidoyta）的分类
1 单毛菌纲（onoblepharidoycetes）
特征：
游动孢子：具单根后生鞭毛（与壶菌门的多鞭毛游动孢子不同）。
生活史：有明显的有性生殖阶段，形成卵配生殖（oogay）结构。
生态：腐生或兼性寄生，主要生活在淡水环境（如池塘、湖泊中的腐烂植物残体）。
主要目及代表属：
1 单毛菌目（onoblepharidales）
代表属：
onoblepharis（单毛菌属）：模式属，菌丝体发达，产生藏卵器和雄器。
gonapodya（弯孢菌属）：菌丝体简化，常腐生于水生植物。
harpochytriu（弓霉属）：单细胞或简单菌丝，附着于藻类或植物残体。
特点：有性生殖时，雄性配子（游动精子）与雌性藏卵器结合，类似某些藻类的生殖方式。
分类学争议与演化意义
早期分化类群：分子系统学研究表明，单毛菌门与壶菌门（chytridioyta）和芽枝霉门（bstocdioyta）同属早期真菌分支，但因其独特的鞭毛结构和有性生殖方式被独立为门。
形态简化：部分属（如 harpochytriu）的菌丝体退化为单细胞，可能与寄生或腐生生活方式相关。
生态与科研价值
演化研究：单毛菌门的有性生殖机制（卵配生殖）为研究真菌与动物的生殖演化提供了线索。
淡水生态：参与有机物分解，维持水生微生物循环。